索马里全国有大小机场62座，其中仅有7座有铺面跑道。主要机场有：首都摩加迪沙亚丁·阿卜杜勒国际机场（Aden Abdulle International Airport）、索马里兰州首府哈尔格萨埃加勒国际机场（Egal International Airport），邦特兰州博萨索国际机场（Bosaso International Airport）、索马里兰州柏培拉机场（Berbera Airport）、邦特兰州与加尔穆杜格州交界处加尔卡尤阿卜杜拉希·优素福机场（Abdullahi Yusuf Airport），国际航班可达吉布提、伊斯坦布尔、内罗毕、亚的斯亚贝巴、迪拜和多哈等地，国内航班可达各主要城镇。

索马里交通以公路为主，无铁路。索境内连年战乱，基础设施建设薄弱，目前公路总里程约为2.2万公里，其中铺装路面仅有约2900公里，且因国内冲突和非政府武装袭扰，陆路交通不畅，关卡较多。

索马里拥有非洲大陆最长的海岸线，约3300公里，主要港口有摩加迪沙港、基斯马尤港、柏培拉港和博萨索港。境内河流较少，只有流经中部的谢贝利河和南部的朱巴河常年有水，其余皆为季节性河流。

摩加迪沙城区街道布局较为整齐，路面硬化率较高，但破损严重。无公交系统，仅有私人运营的各式面包车、三轮摩托往返载客，车况差，事故多发。

索马里兰州首府哈尔格萨市区路面硬化率为60%左右。因地处山谷地带，有较多的U形起伏路面。有公交系统，但都比较拥挤；出租车以两厢小车为主，车况和卫生条件一般。

邦特兰州首府加洛韦市内交通以出租车为主，道路状况较好。

摩加迪沙：索马里首都，历史古城，地处谢贝利河流域，濒临印度洋，热带沙漠气候，预计2023年人口将达到261万，是全国最大城市和主要港口之一。近年来，因冲突、自然灾害导致的国内流离失所者不断涌入，摩加迪沙已成为非洲人口密度最大的城市之一。

哈尔格萨：索马里第二大城市，索马里兰州首府，位于奥戈高地山谷地带，海拔约1300米，气候温和，预计2023年人口将达到112万。西北有陆路与吉布提首都吉布提市相通，市内有小型畜产品加工、食品、金属制品、电力等工业。

基斯马尤：索马里南部港市、第三大城市，近朱巴河河口，濒临印度洋。

加洛韦：邦特兰州首府，是连接索中南部和西北部的交通枢纽。拥有较完善供水、供电、通讯等城市基础设施。热带沙漠气候，以山羊、骆驼畜牧业为主要经济来源。